Hồ Sơ Tuyệt Mật (Phần 9)

Sang đến mùa này, câu chuyện bắt đầu bằng quyết định bất ngờ khi Mulder chủ động trốn đi để giữ an toàn tuyệt đối cho Scully và bé William. Anh chàng đặc vụ Doggett thì rất muốn lùng ra Mulder nhằm phục vụ cuộc điều tra nhắm vào Phó Giám đốc Kersh, nhưng rồi đành dừng lại sau lời khuyên can chân thành từ Scully và Skinner. Thế là Scully vừa phải tự mình lo toan, vừa hỗ trợ Doggett cùng Reyes xem xét các vụ án kỳ lạ. Biến cố lớn ập đến khi một nhóm tôn giáo tìm mọi cách hãm hại con trai cô. Scully đã nhờ vả những người bạn Lone Gunmen trợ giúp nhưng cũng không ngăn nổi vụ bắt cóc, khiến cô rơi vào hoàn cảnh vô cùng quặn thắt. Đến lúc tưởng chừng bế tắc nhất, cô lại hay tin Mulder đang bị lực lượng quân sự bắt giam với tội danh sát hại một kẻ không thể chết.