Cốt truyện khởi nguồn từ việc quê hương cổ xưa của loài Genesect bị xóa sổ hoàn toàn sau hàng trăm triệu năm biến thiên, biến những ngọn núi tuyết kỷ Cổ sinh thành vùng đất hoang tàn không thể cư ngụ. Một số cá thể may mắn sống sót đã dấn thân vào hành trình phiêu bạt để tìm kiếm nơi định cư mới dưới sự dẫn dắt của Shiny Genesect cùng người bạn đồng hành Mewtwo. Khi trôi dạt đến thành phố New Tork, nhận thấy những tòa nhà chọc trời gợi nhớ về nơi ở cũ, nhóm Genesect đã quyết định chiếm lĩnh khu trung tâm, xua đuổi các sinh vật khác và đe dọa cuộc sống của cư dân. Tình hình trở nên căng thẳng tột độ khi cuộc chạm trán nảy lửa giữa thủ lĩnh Genesect và Mewtwo có thể hủy hoại toàn bộ thành phố, buộc Satoshi cùng các bạn phải can thiệp để ngăn chặn thảm họa. Tác phẩm Pokemon Movie 16: Gensect Thần Tốc - Mewtwo Thức Tỉnh là phim hoạt hình phiêu lưu, hành động của Nhật Bản phát hành năm 2013 với thời lượng 72 phút. Phim có sự góp mặt của các diễn viên Ikue Otani, Aoi Yuki và Rica Matsumoto.