Shuriken Sentai Nininger Vs Toqger mở đầu khi gia tộc ninja Igasaki bất ngờ đối mặt với hiểm họa khôn lường từ Bác sĩ Bóng tối Maburo, một thế lực thuộc Shadow Line. Tên ác nhân này đã đánh cắp sức mạnh Nintality của Aka Ninger thật để tạo ra một bản sao tà ác phục vụ dưới trướng hắn. Việc mất đi nguồn sức mạnh cốt lõi đẩy tính mạng của Takaharu vào tình thế ngàn cân treo sợi tóc, khiến toàn đội Ninninger rơi vào cơn khủng hoảng trầm trọng. Trong thời khắc ngặt nghèo, họ may mắn hội ngộ nhóm ToQger, những chiến binh từng đánh bại Shadow Line trong quá khứ, và cùng nhau bắt tay hợp lực để cứu vãn tình thế. Bộ phim hành động hợp tác Shuriken Sentai Nininger Vs Toqger do Nhật Bản sản xuất năm 2016, có thời lượng 1 giờ 4 phút, với sự tham gia của dàn diễn viên Shunsuke Nishikawa, Gaku Matsumoto và Kaito Nakamura.