Ghost in the Shell Arise - Border 1: Ghost Pain lấy mốc thời gian vào năm 2027, đúng một năm sau khi cuộc chiến tranh phi hạt nhân lần thứ tư khép lại. Trong lúc thành phố Tân Cảng vẫn đang oằn mình khắc phục hậu quả xung đột thì một vụ nổ bom do mìn tự hành bất ngờ phát nổ, kéo theo vụ ám sát một sĩ quan quân đội dính líu đến đường dây hối lộ buôn bán vũ khí quân sự. Trong quá trình điều tra vụ án, Daisuke Aramaki thuộc Bộ phận An ninh Công cộng đã chạm trán Motoko Kusanagi, một nữ đặc vụ người máy sở hữu kỹ năng tấn công mạng vượt trội thuộc Đơn vị Bí mật 501. Cùng lúc đó, Batou đặt nghi vấn Kusanagi chính là thủ phạm của vụ nổ, thanh tra Togusa bám theo những vụ giết người bí ẩn, còn bản thân Motoko lại bị giám sát gắt gao bởi cấp trên Kurutsu. Bộ phim hành động hình sự khoa học viễn tưởng của Nhật Bản có thời lượng 58 phút, quy tụ dàn diễn viên lồng tiếng gồm Maaya Sakamoto, Kazuya Nakai, Shunsuke Sakuya, Kenichirou Matsuda và Ikkyu Juku.