Mười năm sau những sự kiện trên truyền hình, phi hành đoàn tàu không gian Sidonia đang ráo riết chuẩn bị cho cuộc đụng độ quyết định với chủng loài sinh vật bí ẩn Gauna, với hy vọng thiết lập chốn an cư trên hành tinh thứ bảy thuộc hệ sao Lem. Trong bối cảnh ấy, phi công át chủ bài Nagate cùng cô gái Tsumugi đang trải qua mối tình thắm thiết. Thế nhưng, bình yên mong manh nhanh chóng bị đe dọa khi dã tâm hiểm độc của một nhà khoa học ẩn nấp trong thân xác thiếu niên bất ngờ trỗi dậy, làm đảo lộn toàn bộ cục diện chiến đấu. Tác phẩm điện ảnh hoạt hình khoa học viễn tưởng Nhật Bản Hiệp Sĩ Sidonia có thời lượng 120 phút, với sự tham gia lồng tiếng của Ryota Osaka, Aya Suzaki và Aki Toyosaki.