Nhân vật trung tâm của câu chuyện là Yoko Nakajima, một nữ sinh trung học có cuộc sống hoàn toàn bình thường. Biến cố xảy ra khi một thế giới bí ẩn khác gồm mười hai vương quốc do mười hai vị vua cai quản cùng mười hai tộc trưởng bất ngờ bị một nhân vật mang tên Keiki chiếm đoạt. Bị cuốn sang vùng đất xa lạ không rõ lý do, Yoko phải đối mặt với vô vàn câu hỏi về sự tồn tại của nơi này cũng như mục đích đưa cô tới đây. Giữa muôn vàn trắc trở và bỡ ngỡ, cô nữ sinh trung học buộc phải tìm cách thích nghi với thế giới hoàn toàn xa lạ và nỗ lực để duy trì sự sống của chính mình. Thập nhị quốc ký là bộ phim hoạt hình hành động của Nhật Bản có độ dài 45 tập, với thời lượng khoảng 26 phút mỗi tập.