Little Busters!: Refrain đưa người xem trở lại với nhóm bạn thân thiết sau thất bại ở trận thi đấu bóng chày đầu tiên. Thay vì nản lòng, cả đội cùng nhau quây quần bên một bữa tiệc bánh kếp ấm cúng nhằm xốc lại tinh thần đoàn kết. Cùng lúc đó, khoảng thời gian gần một học kỳ đã trôi qua kể từ ngày Kyousuke Natsume quay trở về nhóm. Trong bối cảnh ấy, cậu học sinh Riki Naoe vẫn luôn bền bỉ đồng hành và sẻ chia cùng từng thành viên của nhóm Little Busters. Cậu lắng nghe và giúp đỡ cả những gương mặt cũ lẫn những người bạn mới vượt qua các rào cản tâm lý cùng vô vàn trăn trở, mâu thuẫn phức tạp đang giấu kín trong lòng mỗi người. Bộ phim hoạt hình truyền hình Nhật Bản này gồm tất cả 13 tập phát sóng trọn vẹn.