Freezing Vibration đặt trong bối cảnh sau khi cuộc đụng độ lần thứ mười với thực thể NOVA khép lại. Tổ chức Chevalier nhận thấy tần suất xuất hiện của kẻ thù NOVA ngày càng đều đặn và nguy hiểm hơn, trong khi số lượng chiến binh Pandora bị hao hụt vượt xa khả năng đào tạo và tạo mới của họ. Đứng trước nguy cơ thiếu hụt lực lượng bảo vệ nhân loại, tổ chức đã quyết định xúc tiến Dự án E-Pandora mang tính bước ngoặt. Mục tiêu trọng tâm của kế hoạch này là tiến hành can thiệp để ban tặng sức mạnh đặc biệt cho những con người bình thường, biến họ thành các chiến binh Pandora phục vụ trên tiền tuyến chống lại thảm họa. Tác phẩm hoạt hình hành động này đến từ Nhật Bản, có độ dài hoàn chỉnh gồm 12 tập.