Sau sự ra đi đau buồn của một người bạn thân thiết, Shinji Ikari rơi vào trạng thái suy sụp tinh thần và hôn mê sâu. Tình trạng này khiến cậu hoàn toàn không còn khả năng điều khiển cỗ máy người máy Evangelion Unit-01 để tham gia chiến đấu. Nhân cơ hội đó, chỉ huy Gendou Ikari của tổ chức NERV bước vào một cuộc chạy đua khốc liệt nghẹt thở với tổ chức SEELE hoạt động trong bóng tối. Cả hai phe đều ráo riết hành động nhằm mục đích kích hoạt và hoàn tất kế hoạch tối hậu của riêng mình trước đối phương. Neon Genesis Evangelion: The End of Evangelion là tác phẩm hoạt hình chiếu rạp tiêu biểu của Nhật Bản, được công chiếu vào năm 1997.