Shin Kamen Rider: Prologue xoay quanh cuộc đời đầy bi kịch của Shin Kazamatsuri, một tay đua mô tô từng tràn trề triển vọng trên đường đua tốc độ. Một chấn thương nghiêm trọng xảy ra cách đây hai năm đã chôn vùi hoàn toàn sự nghiệp cùng ước mơ thời trai trẻ của anh. Rời xa đường đua, Shin chấp nhận trở thành đối tượng thử nghiệm trong dự án nghiên cứu do chính người cha là tiến sĩ Kazamatsuri Daimon cùng người cộng sự Onizuka Giichi phụ trách. Thế nhưng, quá trình biến đổi sinh học đã kéo theo những biến chuyển kinh hoàng về mặt tâm lý và cơ thể. Shin liên tục bị ám ảnh bởi những cơn ác mộng rùng rợn về hàng loạt cái chết đẫm máu vừa xảy ra xung quanh, với linh cảm đáng sợ rằng chính bản thân anh mới là kẻ thủ ác đứng sau những vụ sát hại man rợ đó. Anh rơi vào nỗi hoang mang tột độ khi ranh giới giữa bản ngã con người và quái vật dần bị xóa nhòa. Tác phẩm hoạt hình hành động giả tưởng mang phong cách u tối do các nhà làm phim phát hành vào năm 1992, mở ra một chương khởi đầu đầy day dứt về nguồn gốc của chiến binh cải tạo.