Mùa phim mở đầu với tình cảnh sinh tử ngàn cân treo sợi tóc khi chuỗi mã gen biến đổi khiến nữ đặc vụ Scully rơi vào tình trạng nguy kịch cận kề cái chết. Nhằm chuộc lại lỗi lầm vì từng dính líu vào một trò lừa bịp về người ngoài hành tinh, đặc vụ chính phủ Michael Kritschgau đã chủ động hợp tác hỗ trợ Mulder tìm kiếm phương thức cứu chữa cho cộng sự. Những bí mật di truyền tiếp tục là tâm điểm của cuộc điều tra khi Scully phát hiện mình là mẹ ruột của cô bé Emily, sự việc gợi lại vụ bắt cóc bí ẩn năm xưa. Cùng lúc đó, sự xuất hiện của cậu bé Gibson Praise, người mang dấu vết di truyền chứng minh mối liên kết giữa loài người với chủng tộc ngoài Trái Đất, dần trở thành chìa khóa then chốt mở ra các hồ sơ tối mật. Hồ Sơ Tuyệt Mật (Phần 5) thuộc thể loại hình sự, phiêu lưu và chính kịch của điện ảnh Âu Mỹ với độ dài 20 tập, mỗi tập kéo dài 45 phút. Bộ phim quy tụ các diễn viên quen thuộc như David Duchovny, Gillian Anderson và Mitch Pileggi.