Mở đầu câu chuyện là tình cảnh hiểm nghèo của đặc vụ Mulder khi anh phải nằm trong phòng chăm sóc thần kinh đặc biệt do não bộ bị tấn công bởi những xung điện chết người. Cùng thời điểm đó, người cộng sự Scully nỗ lực giải mã các ký hiệu bí ẩn trên một con tàu không gian lạ được phát hiện dưới đáy biển ngoài khơi bờ biển Tây Phi. Mối liên hệ giữa tình trạng của Mulder và vật thể bí ẩn chỉ là điểm khởi đầu cho hàng loạt biến cố đau thương tiếp theo, khi Mulder phải đối diện với cái chết của mẹ cùng sự ra đi của Diana Fowley trong hành trình tìm kiếm em gái Samantha. Trong khi đó, Scully cũng phải chạm trán những nỗi ám ảnh tăm tối từ quá khứ, trước khi một sự kiện kinh hoàng mới ập đến làm thay đổi toàn bộ cục diện của hai đặc vụ. Bộ phim truyền hình trinh thám ly kỳ Hồ Sơ Tuyệt Mật (Phần 7) của Âu Mỹ gồm 22 tập, có sự tham gia của David Duchovny, Gillian Anderson và Mitch Pileggi.