Câu chuyện bắt đầu khi chính phủ Mỹ hoàn thiện một hệ thống mật mã tối mật được đánh giá là tuyệt đối bất khả xâm phạm. Thế nhưng, điều chấn động xảy ra khi một cậu bé chín tuổi mắc chứng tự kỷ lại có thể giải mã toàn bộ chuỗi ký tự bí mật này một cách vô cùng dễ dàng, vô tình biến bản thân thành tâm điểm hiểm họa. Lo sợ bí mật an ninh quốc gia bị rò rỉ, đại tá Nicholas Kudrow rắp tâm thực hiện kế hoạch thủ tiêu nhân chứng nhỏ tuổi. Trước sự truy sát tàn độc từ các tay sát thủ chuyên nghiệp, đặc vụ FBI Art Jeffries quyết tâm đứng ra chở che, kéo cả hai vào cuộc rượt đuổi nghẹt thở để bảo vệ sinh mạng cậu bé. Tác phẩm Mật Mã Mercury thuộc dòng phim hành động hình sự gay cấn kết hợp chính kịch của điện ảnh Âu Mỹ với thời lượng 111 phút. Dự án có sự tham gia của dàn diễn viên nổi bật bao gồm Bruce Willis, Alec Baldwin và diễn viên nhí Miko Hughes.