Câu chuyện xoay quanh Twilight, điệp viên hàng đầu của Westalis dưới vỏ bọc bác sĩ Loid Forger. Để thực hiện nhiệm vụ điều tra chính trị gia Donovan Desmond tại học viện Eden danh giá, anh lập một gia đình giả cùng người vợ Yor Briar và cô con gái nuôi Anya. Dù che giấu thân phận với nhau, cả ba thành viên đều nắm giữ bí mật lớn: Yor là một sát thủ mang danh Công chúa Thorn, còn cô bé Anya lại có khả năng đọc thấu suy nghĩ. Trong phần này, bí mật của cha mẹ vẫn được giữ kín với đối phương nhưng Anya đã thấu suốt tất cả. Mâu thuẫn bùng nổ khi cả gia đình cùng bước lên chuyến tàu tốc hành sang trọng. Trong lúc Yor phải thực hiện nhiệm vụ ngăn chặn nhóm sát thủ tiếp cận mục tiêu, Loid lại phải đối mặt với thử thách học cách trở thành người cha chu đáo trong kỳ nghỉ cùng gia đình. Tác phẩm hoạt hình Gia Đình Điệp Viên (Phần 2) do Nhật Bản sản xuất, phát hành năm 2023, mang phong cách hài kịch gia đình ấm áp. Phần phim này trọn vẹn trong 12 tập với thời lượng khoảng 23 phút mỗi tập.