Điệp Viên Ẩn Danh xây dựng câu chuyện xoay quanh hai cá nhân sở hữu cá tính và phong cách hoàn toàn trái ngược nhau: siêu điệp viên Lance Sterling bóng bẩy, lịch lãm và nhà khoa học trẻ Walter Beckett vụng về trong giao tiếp. Dẫu thiếu hụt kỹ năng xã hội, Walter lại sở hữu trí tuệ thiên tài khi tự tay chế tạo ra hàng loạt phát minh và tiện ích tối tân hỗ trợ Lance trong các nhiệm vụ nguy hiểm. Biến cố bất ngờ ập đến khiến tình thế đảo lộn hoàn toàn, buộc hai con người không đội trời chung này phải học cách nương tựa vào nhau theo cách chưa từng có tiền lệ. Nếu không thể gạt bỏ những bất đồng để phối hợp nhịp nhàng như một đội thực thụ, mối đe dọa toàn cầu sẽ bùng phát và đặt cả thế giới trước nguy cơ diệt vong. Tác phẩm hoạt hình hành động hài hước của điện ảnh Âu Mỹ có thời lượng 102 phút, quy tụ sự tham gia lồng tiếng của dàn diễn viên nổi tiếng gồm Will Smith, Tom Holland và Ben Mendelsohn.