Câu chuyện xoay quanh hai anh em nhà giả kim Edward Elric và Alphonse Elric. Xuất phát từ nỗi đau mất mẹ cùng ước muốn hồi sinh người thân, họ đã dại dột phạm vào điều cấm kỵ lớn nhất của thuật giả kim là chuyển hóa người sống. Biến cố tang thương này đã tước đoạt đi thân thể của cả hai, buộc Edward phải đánh đổi một phần cơ thể để phong ấn linh hồn người em Alphonse vào trong một bộ giáp kim loại rỗng. Để tìm lại những gì đã mất và khôi phục thân xác nguyên vẹn, hai anh em quyết định lên đường tìm kiếm Hòn đá phù thủy huyền thoại. Hành trình phiêu lưu đầy nguy hiểm đưa họ dấn thân vào những bí ẩn chấn động, đối mặt với hàng loạt kẻ thù nguy hiểm cùng những mặt tối của thuật giả kim. Bộ phim hoạt hình dài tập Giả Kim Thuật Sư: BROTHERHOOD thuộc thể loại hành động, bí ẩn kết hợp phiêu lưu của Nhật Bản, phát hành năm 2009 với độ dài 64 tập.