Thám tử nhí Conan một lần nữa bị cuốn vào vòng xoáy đối đầu sinh tử với Tổ chức Áo đen, tổ chức ngầm tàn độc từng gieo rắc bi kịch cho cuộc đời cậu. Nguy cơ bắt đầu bùng phát khi các thành viên cộm cán của tổ chức phát hiện ra thám tử trung học Kudo Shinichi vẫn còn sống sót sau lần bị ép uống độc dược, đồng thời lần ra tung tích cậu đang ẩn thân dưới vỏ bọc một học sinh tiểu học. Mối nguy hiểm nhanh chóng lan rộng khi mọi cá nhân thân thiết xung quanh Conan đều có nguy cơ rơi vào tầm ngắm thanh trừng gắt gao của những tay súng khét tiếng. Đứng trước sự an nguy của người thân và bạn bè, thám tử nhí buộc phải vận dụng toàn bộ trí tuệ sắc bén nhằm che giấu thân phận, bảo vệ những người quan trọng và ngăn chặn kế hoạch sát hại tàn bạo của đối phương. Thám Tử Lừng Danh Conan 13: Truy Lùng Tổ Chức Áo Đen là bộ phim hoạt hình trinh thám ly kỳ của Nhật Bản phát hành năm 2009 với thời lượng 111 phút, do đạo diễn Yasuichiro Yamamoto dàn dựng cùng sự tham gia lồng tiếng của Megumi Hayashibara, Akira Kamiya, Minami Takayama, Kappei Yamaguchi, Wakana Yamazaki và Kenichi Ogata.