Sở Cảnh sát tiếp nhận thông tin chấn động về vụ nổ tại Viện vi sinh học Tokyo ở khu vực Nishitama do tổ chức khủng bố có tên Mèo Xiêm Đỏ thực hiện, dấy lên mối lo ngại rằng chúng đã chiếm đoạt một loại virus lây nhiễm cực kỳ nguy hiểm. Trong khi đó, nhằm giăng bẫy bắt giữ siêu trộm Kaito Kid, ông Suzuki Jirokichi đã vận hành chiếc khinh khí cầu khổng lồ Bell 3 mang theo viên ngọc quý Thiếu nữ bầu trời, đồng thời mời nhóm của thám tử Mori Kogoro cùng Đội Thám tử nhí tham gia hành trình hướng về Osaka.
Chuyến bay nhanh chóng rơi vào hỗn loạn khi toàn bộ khinh khí cầu bị lực lượng khủng bố chiếm quyền kiểm soát và đe dọa kích nổ nếu hành khách có hành vi kháng cự. Căng thẳng leo thang khi các nạn nhân trên tàu bắt đầu xuất hiện triệu chứng nhiễm độc, trong đó có cả Ran Mori, buộc Conan phải gấp rút tìm cách vô hiệu hóa kẻ thù giữa không trung.
Thám Tử Lừng Danh Conan 14: Con Tàu Biến Mất Giữa Trời Xanh là tác phẩm hoạt hình trinh thám hành động của Nhật Bản ra mắt năm 2010 với thời lượng 103 phút. Phim do đạo diễn Yasuichiro Yamamoto thực hiện, cùng sự tham gia lồng tiếng của Minami Takayama, Kappei Yamaguchi, Wakana Yamazaki, Rikiya Koyama, Megumi Hayashibara và Kenichi Ogata.