Sau một trận chiến căng thẳng với Tiến sĩ Animo tại một nhà máy điện, Ben nhận thấy thiết bị Omnitrix có những dấu hiệu trục trặc bất thường nhưng cậu quyết định giữ kín chuyện này. Ngay sau đó, Tetrax xuất hiện và mang đến một thông tin chấn động rằng chiếc đồng hồ Omnitrix đang phát đi tín hiệu tự hủy cực kỳ nguy hiểm. Để ngăn chiếc đồng hồ phát nổ kéo theo sự diệt vong của chính nó lẫn toàn bộ vũ trụ, Ben cùng Tetrax buộc phải bắt đầu chuyến du hành tìm kiếm người tạo ra Omnitrix để sửa chữa kịp thời. Chuyến đi càng trở nên phức tạp hơn khi cô em họ Gwen bí mật đi theo để hỗ trợ người anh em của mình vượt qua hiểm nguy. Ben 10: Bí Mật Của Omnitrix là bộ phim hoạt hình viễn tưởng thuộc thể loại hành động và gia đình của Âu Mỹ, phát hành năm 2007 với thời lượng 71 phút. Phim do Scooter Tidwell và Sebastian Montes làm đạo diễn, cùng sự tham gia của dàn diễn viên gồm Tara Strong, Dee Bradley Baker, Fred Tatasciore, Steve Blum, Dave Wittenberg và Vanessa Marshall.