Cậu Ma Nhà Xí Hanako (Phần 2) mở ra câu chuyện tại Học viện Kamome, nơi lưu truyền lời đồn về một chiếc đồng hồ thời gian bí ẩn do ba người bảo hộ cai quản ba mốc quá khứ, hiện tại và tương lai. Trật tự trường học bỗng chốc đảo lộn dữ dội khi một biến cố kỳ lạ xảy ra, khiến các cô cậu học sinh bị lão hóa một cách đột ngột trong khi các công trình kiến trúc xung quanh nhanh chóng trở nên mục nát, đổ vỡ. Trước tình cảnh nguy nan, Nene Yashiro cùng Kou Minamoto đã quyết định nhờ cậy sự trợ giúp từ linh hồn Hanako-kun để truy tìm kẻ đứng sau màn hỗn loạn này. Trên chặng đường điều tra, họ không chỉ khám phá ra manh mối của thủ phạm mà còn chạm tới những bí mật ngầm và những ràng buộc định mệnh gay cấn, nơi người sống và các linh hồn đều bị cuốn vào vòng xoáy thử thách. Tác phẩm hoạt hình Nhật Bản có độ dài 24 tập, thời lượng 24 phút mỗi tập, dung hòa nhiều yếu tố từ hành động, phiêu lưu đến bí ẩn và học đường. Phim do đạo diễn 福井洋平 thực hiện với sự tham gia của dàn diễn viên Megumi Ogata, Akari Kito, Shoya Chiba, Shunichi Toki, Yuma Uchida và Chika Anzai.