Điệp Viên Siêu Hạng (Phần 5) tiếp tục xoay quanh cuộc sống hai mặt của ba nữ điệp viên thiếu niên tài ba gồm Sam, Clover và Alex. Dù mỗi người mang một cá tính riêng biệt, cả ba luôn phối hợp ăn ý để thực hiện các nhiệm vụ trấn áp tội phạm nguy hiểm quốc tế dưới sự điều hành từ Jerry, người đứng đầu cơ quan WOOHP. Đằng sau công việc nguy hiểm, vị thủ trưởng nghiêm nghị này lại tìm cách giấu mẹ chuyện cơ quan bằng việc nhận mình làm quản lý khách sạn. Bên cạnh các điệp vụ, ba cô gái vẫn duy trì nhịp sống học đường và hẹn hò như bạn bè đồng trang lứa. Mẹ của họ, khi biết bí mật của con cái, đã chu cấp một căn nhà lớn gần trường để các cô gái tiện vừa sinh hoạt vừa sẵn sàng làm nhiệm vụ bí mật. Loạt phim hoạt hình của Pháp kết hợp phiêu lưu, hành động và hài hước gồm 26 tập, mỗi tập khoảng 22 phút, do Vincent Chalvon-Demersay và David Michel đạo diễn cùng sự tham gia của các diễn viên Geneviève Doang, Claire Guyot, Fily Keita, Céline Mauge, Jean-Claude Donda và Déborah Claude.