Câu chuyện bắt đầu với biến cố bí ẩn khi Yuri, một nữ sinh Nhật Bản thời hiện đại, bất ngờ bị kéo qua một vũng nước kỳ lạ và xuyên không về thế kỷ 14 trước Công nguyên tại Đế quốc Hittite cổ đại. Lạc lõng giữa một nền văn minh xa lạ và khốc liệt, cô gái trẻ lập tức bị cuốn vào vòng xoáy tranh giành quyền lực hoàng gia đầy nguy hiểm. Để bảo toàn tính mạng, Yuri quyết định liên minh cùng Hoàng tử Kail, sát cánh đối đầu với những thế lực ám sát và vượt qua các cạm bẫy chính trị nơi cung đình. Trải qua nhiều phen khói lửa chiến trận, lòng can đảm và trí thông minh đã giúp cô được tôn xùng như hóa thân của nữ thần chiến tranh Ishtar. Đứng trước danh tiếng và những mối liên kết sâu đậm mới, Yuri phải trăn trở giữa khao khát tìm đường trở về thời đại của mình hay chấp nhận bước tiếp cùng vận mệnh lịch sử. Phim hoạt hình Dòng Sông Huyền Bí thuộc thể loại hành động, phiêu lưu và chính kịch của Nhật Bản, được sản xuất với quy mô 12 tập, mỗi tập có độ dài 23 phút. Tác phẩm quy tụ dàn diễn viên lồng tiếng gồm Haruki Ishiya, Junya Enoki, Shoya Chiba, Natsumi Kawaida, Tomoaki Maeno và Shiki Aoki.