Giải Mã Kỳ Án (Phần 3) tiếp tục câu chuyện khoa học viễn tưởng kịch tính sau hàng loạt biến cố bất thường khiến nữ đặc vụ Olivia bị giam cầm tại một thực tại song song ở phía bên kia. Bị cô lập giữa một môi trường xa lạ và đầy cạm bẫy, cô phải dốc hết sức lực tìm cách vượt qua hiểm nguy để trở về quê nhà. Trong khi đó, ở thế giới thực, hai đồng sự Peter và Walter hoàn toàn không hay biết sự thật và vẫn tiếp tục cuộc sống cùng công việc điều tra bên cạnh một phiên bản Olivia thay thế đầy toan tính. Sự tráo đổi thân phận này dẫn tới những rạn nứt ngầm và nguy cơ đe dọa sự an nguy của cả hai vũ trụ. Mùa phim thuộc thể loại khoa học viễn tưởng, gay cấn, bí ẩn và chính kịch của truyền hình Âu Mỹ, gồm 22 tập với thời lượng khoảng 46 phút mỗi tập. Tác phẩm có sự góp mặt của các diễn viên Anna Torv, Joshua Jackson, John Noble và Jasika Nicole.