Chuyện bắt đầu từ tận năm 2003 ở vùng đất Okinawa. Khi ấy, cô bạn nữ sinh Miu để ý đến anh khóa trên Minato vừa mồ côi cả cha lẫn mẹ. Muốn người kia vơi bớt nỗi buồn, cô nàng rủ anh cùng nhau trao đổi những cuốn băng nhạc tự phối trên chiếc đĩa MiniDisc nhỏ xinh. Thế rồi Minato lên Tokyo, hai người phải yêu xa, và Miu cũng quyết tâm thi đại học ở thủ đô để được ở gần anh. Tiếc là những ngày tháng tìm việc khó khăn sau đó lại kéo theo lời chia tay đột ngột từ Minato, khiến cô phải ngậm ngùi trở lại quê nhà.
Mãi đến năm 2024, tức mười lăm năm trôi qua, Miu giờ đã có gia đình riêng cùng người bạn thanh mai trúc mã Ryusei. Giữa lúc chống chọi với căn bệnh nan y, cô quyết định gửi con gái Himari đến Tokyo, mang theo chiếc đĩa MiniDisc năm nào để trao lại cho Minato lời nhắn nhủ chưa từng nói hết. Nếu bạn đang tìm một câu chuyện tình cảm nhiều nỗi niềm, 366 Ngày sẽ là lựa chọn rất đáng lắng lòng theo dõi.